A webáruház biztonsága, problémamentes működése létfontosságú. Ha valami nem működik, nincs rendelés – nincs bevétel. Éppen ezért kiemelt fontosságú weboldalad technikai karbantartása, ami a rendszeres mentéseken kívül megköveteli, hogy rendszered mindig a legfrissebb verziójú legyen.
Nem a te válladat nyomja ez a teher, ha webáruházadat bérled, hiszen a bérleti díj nem csak a használat, hanem a karbantartás, frissítés, fejlesztés, stb. díját is magában foglalja. Ha viszont valamilyen open source, ingyenes webáruházat használsz, a biztonságról, karbantartásról, frissítésről magadnak kell gondoskodni. Amellett hogy a webáruházadról rendszeresen biztonsági mentést készítesz, figyelned kell a rendszer újabb és újabb kiadásainak (frissítések) megjelenésére, hiszen ezek a frissítések sokszor biztonsági hibákat is javítanak.